Sull’isola di Lipari, nel complesso del castello che la domina, è collocato il Museo archeologico regionale eoliano. E’ il museo specifico delle isole Eolie. La gran parte, infatti, del materiale esposto proviene da scavi effettuati sull’arcipelago, da archeologi del calibro di Madeleine Cavalier e Luigi Bernabò Brea. A quest’ultimo è intitolato il museo.
Il museo fu aperto nel secondo dopoguerra ed organizzato in 40 sale, distribuite nel complesso del castello. Si organizza in diverse sezioni, che includono: preistoria, paleontologia, periodo classico greco-romano, epigrafia e vulcanologia. Si distingue la sezione che presenta numerosi ritrovamenti effettuati in mare, grazie ad una attenta opera di archeologia subacquea. Esiste, inoltre, una specifica sezione riservata alle scoperte archeologiche operate sulle altre isole minori eoliane.

La lunga storia delle isole eolie, che parte dall’epoca preistorica ed arriva ad oggi, è ben descritta e supportata da splenditi esempi riportati alla luce nei decenni scorsi. L’intera collezione comprende, ad esempio, sarcofagi in pietra, interi corredi funerari, vasi, cippi e stele tombali, tutto legato alle tradizioni funebri nelle isole, ma anche sculture, sia in marmo che in pietra,  vasi e ceramiche, maschere teatrali e statue fittili. Ogni oggetto esposto riporta un’attenta catalogazione e descrizione, ma soprattutto, una necessaria contestualizzazione. Tutto questo sia in italiano che inglese,
Il museo archeologico di Lipari ha delle sezioni distaccate sulle isole di Panarea e Filicudi. Interagisce, inoltre, con l'Antiquarium Civico di Salina.